EDI einingar samanstanda venjulega af nokkrum lykilþáttum sem vinna saman að því að staðla og gera sjálfvirkan flutning gagna milli fyrirtækja. Í stórum dráttum má skipta þeim í gagnabreytingarlag, samskiptaflutningslag, viðskiptakortalag og kerfissamþættingarlag, hvert með sína ábyrgð.
Gagnaumbreyting og kortlagningareiningin er einn af kjarnaþáttum EDI. Það er ábyrgt fyrir því að umbreyta hráum gögnum úr innri fyrirtækjakerfum (eins og ERP eða CRM gögnum) í EDI skilaboð sem eru í samræmi við staðlað snið, eins og EDIFACT eða ANSI X12. Samtímis er það einnig ábyrgt fyrir öfugþáttun gagna frá utanaðkomandi samstarfsaðilum, umbreyta þeim í skipulögð gögn sem þekkjast af innri kerfum fyrirtækisins. Reglur um kortlagningu á vettvangi og löggildingarreglur gagna gegna mikilvægu hlutverki í þessu ferli.
Samskipta- og sendingareiningin er fyrst og fremst ábyrg fyrir öruggri sendingu EDI skilaboða milli mismunandi fyrirtækja. Algengar aðferðir eru meðal annars VAN net, AS2 samskiptareglur eða API-miðaðar sendingaraðferðir. Þessi eining inniheldur venjulega einnig skilaboðabiðraðir, endurreynslukerfi og eftirlit með sendingarstöðu til að tryggja áreiðanlega afhendingu gagna jafnvel í flóknu netumhverfi.
Kerfissamþætting og stjórnunareining er notuð til að fella EDI getu inn í núverandi viðskiptakerfi fyrirtækisins. Það er venjulega djúpt samþætt við ERP, WMS eða aðfangakeðjustjórnunarkerfi til að gera sjálfvirkan viðskiptaferla eins og pöntunarvinnslu, sendingu og afstemmingu. Á sama tíma býður þessi eining upp á skráningu, meðhöndlun undantekninga og eftirlitsaðgerðum, sem auðveldar rekja spor einhvers og stjórnun gagnaskiptaferla fyrir fyrirtæki.